Генетический анализ: что это и зачем он нужен?
Рано или поздно все пациенты с наследственной дистрофией сетчатки сталкиваются с вопросом – делать или не делать генетический анализ. Зачастую врачи не дают однозначного ответа, считая, что с одной стороны анализ позволит уточнить диагноз, но с другой – ненужной тратой денег и времени, ведь лечения пока нет.
Что такое генетический анализ
Генетический анализ или анализ ДНК1, который иногда предлагают сделать людям, страдающим от заболеваний зрения, заключается в выделении ДНК из клеток и изучении свойств определенных генов, отвечающих за правильную работу глаз. Таких генов, мутации которых приводят к нарушению зрения, в частности, к проявлениям дистрофии сетчатки или патологии переднего отрезка глаза или в худших случаях к нарушению формирования глаза в эмбриональном развитии, примерно триста. Для этого необходимо выделить в цепи ДНК определенную последовательность нуклеотидов и проанализировать ее на предмет обнаружения мутации.
Существует три типа генетических анализов. Первый — это проверка определённых точечных мутаций, и часто это называют ПЦР-анализ (полимеразная цепная реакция), это тот метод, которым проверяют наличие определенных мутаций в конкретных генах. Обычно это точечные мутации или малые делеции2 или вставки в нить ДНК. И такие анализы относительно дешевые, они стоят в среднем от 5 до 8 тысяч рублей.
Второй тип – это анализ набора генов, еще его называют панелью исследовательских тестов. Для такого анализа есть устоявшееся название Next Generation Sequencing (NGS), означающее, что в этом случае массовым параллельным секвенированием3 одновременно смотрят несколько генов или несколько различных участков. Такие анализы стоят дороже, обычно от 15 до 30-35 тысяч рублей.
И третий вид анализов, он самый дорогой и самый подробный, когда смотрят всё. Либо это секвенирование клинического экзома4, либо полного экзома, либо расшифровка полного генома. И такие анализы стоят обычно от 50 тысяч рублей и выше, в зависимости от сложности, подробности и качества проведения теста.
Обычно при заболеваниях дистрофией сетчатки анализ назначает врач после внимательного сопоставления всех данных о клинической картине и типе наследования заболевания. Чаще всего это NGS-панели, то есть разбор последовательности генов в тех генах, которые отвечают за правильную работу сетчатки. Такой анализ стоит порядка 35 тысяч рублей.
Зачем делать генетический анализ
Во-первых, знание мутации, которая привела к заболеванию, позволяет спрогнозировать течение заболевания, оценить риск передачи заболевания детям, позволяет подобрать поддерживающую терапию. Также, напоминаем, что лечение мутации в гене RPE65, вызывающей пигментный ретинит или Амавроз Лебера, уже существует.
Во-вторых, знание того, мутации каких конкретно генов являются причиной болезни, позволяет точечно отслеживать исследования в сфере геномного редактирования именно генов, связанных с вашим заболеванием. Обзор осуществляемых в настоящее время клинических испытаниях генной терапии можно прочитать на сайте «Чтобы видеть!».
Существуют базы данных, где хранится генетическая информация людей с заболеваниями подобного типа. Такие информационные базы необходимы, в частности, фармацевтическим компаниями, разрабатывающим технологии лечения дистрофии сетчатки, чтобы понимать, пациентов с каким видом заболеваний больше всего. С помощью таких баз (их также называют регистрами) ищут пациентов для участия в исследованиях.
И, если есть такая возможность, в таких базах надо регистрироваться.
В России пока не существует официальной базы данных, поэтому стоит поискать формирующиеся уже сегодня в Интернете группы пациентов со схожими заболеваниями, что позволит поддерживать друг друга и получать от таких людей новую информацию, касающуюся лечения заболевания. Более того, на основе таких групп в будущем, возможно недалеком, будут формироваться регистры пациентов, которые использует государство для распределения лечения, когда оно появится.
В частности, на сайте «Чтобы видеть!» (http://looktosee.ru/anketa) можно оставить информацию о себе и своем заболевании. Эти данные в случае начала клинических исследований (или апробаций, специальных программ и так далее), которые касаются разработки препаратов и методов лечения вашего заболевания, позволят прислать вам информацию об этом.
Как делать анализ
Обычно после визита к офтальмологу / терапевту / педиатру, если он заподозрил наследственную дистрофию сетчатки, пациент или семья чаще всего направляется в специализированную клинику или в один из ведущих офтальмологических центров, которые есть во многих крупных городах, где проводится дополнительное обследование, которое должно включать в себя:
- Выписка врача-офтальмолога об общем состоянии глаз (острота зрения, описание переднего отрезка, внутриглазное давление, описание глазного дна)
- Снимки ОКТ высокого разрешения
- Фото глазного дна (fundus photo)
- Результаты ЭФИ (ЭРГ + ЗВП)
После обследования в такой клинике, имея на руках направление врача, пациент направляется в специализированную лабораторию, где его дважды консультирует генетик: первый раз, чтобы определить оптимальный вид анализа, и второй раз, чтобы его трактовать. В случае рецессивного заболевания иногда нужно сделать анализ и родителям, если лаборатория сделает такой запрос, что позволяет подтвердить диагноз, если, скажем, родители здоровы.
Где делать генетический анализ
- МЕДИКО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР http://www.med-gen.ru/
- ГЕНОМЕД http://www.genomed.ru/
- ОФТАЛЬМИК http://oftalmic.ru/
- ГЕНЕТИКО https://genetico.ru/
С февраля 2022 года начал функционировать единственный в России научно-клинический центр генетики глазных болезней на базе ФГБНУ МГНЦ.
Руководитель- заведующий кафедрой офтальмогенетики, куратор по наследственным глазным болезням РФ, врач-генетик, офтальмолог высшей квалификационной категории ФГБНУ "МГНЦ", к.м.н., проф. РАЕ Кадышев Виталий Викторович. Прием ведет, но очередь к нему по прежнему огромная.
В настоящее время прием ведут три врача. Работают с понедельника по пятницу (исключение праздничные дни). Оснащение центра включает весь современный спектр диагностики в офтальмологии (ОКТ, УЗИ, рефрактометрия, пахиметрия и другие). Таким образом, в МГНЦ осуществляется весь цикл - образование-диагностика офтальмологическая-генетическая диагностика-клинические исследования (по возможности)-терапия (по показаниям и возможностям).
1 ДНК (дезоксирибонуклеи́новая кислота) — макромолекула (одна из трёх основных, две другие — РНК и белки), обеспечивающая хранение, передачу из поколения в поколение биологической информации в виде генетического кода, состоящего из последовательности нуклеотидов.
2 Делеции — хромосомные перестройки, при которых происходит потеря участка хромосомы (генетического матерала).
3 Секвенирование - определение аминокислотной или нуклеотидной последовательности ДНК или РНК.
4 Секвенирование экзома — технология секвенирования всех белок-кодирующих генов (экзонов) в геноме (это и есть экзом). Экзом человека содержит приблизительно 180 тысяч экзонов, что соответствует примерно 1 % всего генома.
ДОПОЛНЕНИЕ
НАУКА (список учреждений РФ и СНГ, у которых в уставной деятельности прописано проведение научных разработок и поиска лечения и у которых есть наработки по темам, интересующим читателей этой тематики/рубрики)
- Институт биологии гена РАН (Москва)
- Институт молекулярной генетики РАН (Москва)
- Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН (Москва)
- ФГБУН институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН (Москва)
- Медико-генетический научный центр РАМН (Москва)
- Институт высшей нервной деятельности (Москва)
- Биокластер Сколково
- ФМБА им. Бурназяна (Москва)
- НИИ ГБ РАМН (Москва)
- НИЦ Курчатовский институт (Москва)
- МНИИ им. Гельмгольца (Москва)
- Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова (Санкт-Петербург)
- Красноярский медицинский институт (кафедра офтальмологии)
- Казанский медицинский университет (кафедра офтальмологии)
- Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН (Уфа)
- Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН (Новосибирск)
- НИИ медицинской генетики (Томск)
- Институт цитологии и генетики СО РАН (Новосибирск)
- Институт генетики и цитологии НАН Белоруссии (Минск)
- Институт клеточной биологии и генетической инженерии НАН Украины (Киев)
- Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины (Киев)
- Институт генетических ресурсов НАН Азербайджан
- Институт общей генетики и цитологии Республики Казахстан
ПРАКТИЧЕСКАЯ ОФТАЛЬМОЛОГИЯ
- НМИЦ Офтальмологии им. С.Н. Федорова (имеет отделения в городах России)
- НИИ ГБ РАМН (Москва)
- МНИИ им. Гельмгольца (Москва)
- Морозовская детская больница (Москва)